Leute... macht es doch nicht so kompliziert! 
Im Textur-Ordner des Busses hast du alle Templates. Das sind die Dateien, die fast gar nicht zu sehen sind - s. Bild dritte Spalte:

Kopiere dir das richtige Template am besten in den Repaintordner und öffne es anschließend in paint.net. Wie Sie sehen, sehen Sie nix:

Du hast das Alpha to 255-Plugin?? Perfekt! Dann nutze es auch!


Jetzt stellst du diese Ebene am besten auf "Multiplizieren" (Doppelklick) und dann gehst du auf OK.

Nun kannst du weitere Ebenen nach Belieben hinzufügen. Alles was unter "Hintergrund" ist, wird wie Lack behandelt (bspw sind die Konturen dadurch dann noch sichtbar), alles was über "Hintergrund" ist wird wie Aufkleber behandelt.
Wenn du mit Allem fertig bist drückst du Strg+Shift+F. Damit werden ALLE Ebenen zu einer einzigen zusammengefasst. Anschließend klickst du wieder doppelt auf die einzig verbliebene Ebene und stellst als Deckkraft 10 ein.
Damit wird die Textur wieder "unsichtbar", der Bus wird aber jedoch korrekt dargestellt.
Ich empfehle dir die Datei mit den einzelnen, noch sichtbaren Ebenen zwischendurch zu speichern, falls du das später noch bearbeiten möchtest!